also erstens mal kannst du fehlerhafte Downloads zu 80% schon vorher aussortieren,wenn du den Sims Filecop benutzt,den du hier kostenlos bekommst: http://www.thesims.de/tools.shtml
dann geb ich dir einen tip,leg dir für jede Kategorie einen Ordner an,so mache ich das auch, also z.B. einen Ordner für "Skins Men", "Skins Women", "Livingroom", "Bathroom" etc.. und leg dort deine Downloads gleich passend ab. Wenn du dir z.b. ein Badezimmer downloadest,speicher es gleich im Ordner Bathrooms und entpacke es von dort in deinen Downloads-Ordner im Spiel.
Wenn dann doch mal ein fehlerhafter Download auftaucht,den der FileCop nicht fand, kannst du in dem betreffenden Ordner anhand des Datums gleich sehen, welches File das war.
Außerdem ist es ziemlich praktisch,wenn du deine Downloads auf CD brennst,dann hast du alles gleich schön passend in den richtigen Ordnern.
Sichern würde ich außerdem an deiner Stelle (wenn jetzt grade alles fehlerfrei läuft zumindest) die Ordner GameData\Skins und Downloads sowie GameData\Walls und GameData\Floors.
Allerdings müßtest du diese dann ja bei jedem Download wieder aktualisieren,daher rate ich zur 1. Methode.